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ZymoBIOMICS®
Darmmikrobiom-Standard
Zuverlässiges Benchmarking für die Darmmikrobiomforschung
Erzielen Sie mit dem ZymoBIOMICS® Darmmikrobiom-Standard genauere und reproduzierbarere Mikrobiomdaten. Dieser definierte mikrobielle Mix wurde entwickelt, um Benchmarking, Qualitätskontrolle und Validierung über alle Schritte hinweg zu unterstützen – von der DNA-Extraktion über die Library-Aufbereitung bis hin zur Sequenzierung und bioinformatischen Analyse. Dank der bekannten Spezien und der charakterisierten relativen Häufigkeiten können Forscher die Leistung ihres Arbeitsablaufs zuverlässig bewerten und Ursachen für Variabilität identifizieren.
Validieren Sie jeden Schritt Ihres Mikrobiom-Workflows
Mikrobiomstudien umfassen oft mehrere Arbeitsschritte, von denen jeder zu Verzerrungen führen kann. Durch die Verwendung eines definierten Referenzstandards können Forscher Ergebnisse mit den erwarteten Werten vergleichen und sicherstellen, dass jede Phase des Arbeitsablaufs wie vorgesehen funktioniert.
Der ZymoBIOMICS®-Darmmikrobiom-Standard kann verwendet werden für:
- Methodenentwicklung und -optimierung
- Benchmarking der DNA-Extraktion
- Validierung von NGS-Workflows
- Qualitätskontrolle zwischen einzelnen Durchläufen
- Laborübergreifende Vergleiche
- Verifizierung der Bioinformatik-Pipeline
Ein definierter mikrobieller Standard für aussagekräftige Vergleiche
Im Gegensatz zu undefinierten biologischen Proben enthält der ZymoBIOMICS® Gut Microbiome Standard eine präzise charakterisierte mikrobielle Zusammensetzung mit bekannter Artenhäufigkeit. Dies ermöglicht eine direkte Bewertung der Extraktionseffizienz, der Leistung bei der Library-Vorbereitung und der Sequenzierungsgenauigkeit.
Der Standard umfasst Vertreter aus verschiedenen mikrobiellen Arten, darunter Bakterien und Pilze, und unterstützt Forscher dabei, die Leistung des Arbeitsablaufs über verschiedene Organismen hinweg zu bewerten.
Zusammensetzung des Standards
|
Arten |
Theoretische Zusammensetzung (%) |
||||
|
Genomische DNA |
Nur 16S |
16S und 18S |
Genomkopien |
Zellzahl |
|
|
Pseudomonas aeruginosa |
12 |
4,2 |
3,6 |
6,1 |
6,1 |
|
Escherichia coli |
12 |
10,1 |
8,9 |
8,5 |
8,5 |
|
Salmonella enterica |
12 |
10,4 |
9,1 |
8,7 |
8,8 |
|
Lactobacillus fermentum |
12 |
18,4 |
16,1 |
21,6 |
21,9 |
|
Enterococcus faecalis |
12 |
9,9 |
8,7 |
14,6 |
14,6 |
|
Staphylococcus aureus |
12 |
15,5 |
13,6 |
15,2 |
15,3 |
|
Listeria monocytogenes |
12 |
14,1 |
12,4 |
13,9 |
13,9 |
|
Bacillus subtilis |
12 |
17,4 |
15,3 |
10,3 |
10,3 |
|
Saccharomyces cerevisiae |
2 |
k. A. |
9,3 |
0,57 |
0,29 |
|
Cryptococcus neoformans |
2 |
k. A. |
3,3 |
0,37 |
0,18 |
Wichtigste Vorteile
Repräsentative Zusammensetzung des Darmmikrobioms
Enthält 21 mikrobielle Stämme, die ausgewählt wurden, um die Komplexität des menschlichen Darmmikrobioms nachzubilden und ein realistisches Benchmarking-Tool bereitzustellen.
Optimiert für Workflows zur Mikrobiomsequenzierung
Bewertung und Validierung von Extraktionsmethoden, Sequenzierungsplattformen und Datenanalyse-Pipelines anhand einer genau definierten Referenzprobe.
Unterstützt die Qualitätskontrolle
Überwachen Sie die Konsistenz zwischen einzelnen Durchläufen, identifizieren Sie Abweichungen im Arbeitsablauf und verbessern Sie die Reproduzierbarkeit über Projekte und Labore hinweg.
Mikrobielle Abdeckung über verschiedene Spezies hinweg
Umfasst Bakterien, Pilze und Archaea für eine umfassende Bewertung des Arbeitsablaufs.
Technische Spezifikationen
| Parameter | Spezifikation |
|---|---|
| Biosicherheit | BSL-1 |
| Fremde mikrobielle DNA | < 0,01 % |
| Referenzgenome |
16S- und 18S-rRNA-Gene |
| Abweichung der relativen Häufigkeit | < 15 % |
| Lagerungslösung | 2X DNA/RNA Shield® |
| Gesamtzellkonzentration | ~3,94 × 10⁹ Zellen/ml |
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Produkt
D6331 ZymoBIOMICS® Darmmikrobiom-Standard
